เรื่องราวเกิดขึ้นในปี 2054 เมื่อประเทศญี่ปุ่นได้กลายเป็นสังคมที่เวทมนตร์ถูกสถาปนาอย่างสมบูรณ์ คุโจว ฮารุโตะ คือนักเรียนที่ถูกสังคมดูแคลน เพราะเขาไม่มีความสามารถด้านเวทมนตร์ใด ๆ เลย เขาต้องทนอยู่ในสถานะของ "นักเรียนที่ด้อยโอกาส" มาโดยตลอด
ชีวิตของฮารุโตะพลิกผันเมื่อจู่ ๆ มี "จดหมายปริศนา" ถูกส่งมาถึงเขา ผู้ส่งไม่ใช่ใครอื่น แต่เป็นตัวเขาเองในอีก 10 ปีข้างหน้า! จดหมายนั้นเปิดเผยคำทำนายสุดช็อกว่า "ในอนาคต คุโจว ฮารุโตะ คุณคือจอมเวทย์ผู้ยิ่งใหญ่ที่สามารถควบคุมมิติและเวลาได้" ฮารุโตะที่เต็มไปด้วยความสงสัยจึงตัดสินใจทำตามคำแนะนำจากตัวเองในอนาคต
การเดินทางเริ่มต้นขึ้นเมื่อเขาดำดิ่งเข้าสู่ดันเจี้ยนระดับ F ที่หลายคนมองข้ามในสวนอิมพีเรียลชินจูกุ และที่นั่นเอง เขาได้ค้นพบ "ห้องลับ" ที่ไม่เคยมีใครล่วงรู้มาก่อน! นี่คือการผจญภัยของเด็กหนุ่มผู้ล้มเหลวที่ค่อยๆ เติบโตขึ้นสู่ตำแหน่งจอมเวทย์แห่งห้วงเวลาที่แข็งแกร่งที่สุด เพื่อลุกขึ้นมาปกป้องโลกทั้งใบจากภัยคุกคาม
/ Alternatives: アナトと時空の魔術師